Salmonella enterica serotypes from human and nonhuman sources in Sao Paulo State, Brazil, 2004-2020.

Salmonellosis ranks among the most frequently reported zoonosis worldwide and is often associated with foodborne outbreaks. Since the 1950s, the distribution of Salmonella serotypes in Sao Paulo State, Brazil, has been documented and periodically reported. In this study, we updated the data on the distribution of Salmonella serotypes received in our reference laboratory, isolated from human infections and nonhuman sources, from 2004 to 2020. In that period, a total of 9,014 Salmonella isolates were analyzed, of which 3,553 (39.4%) were recovered from human samples, mainly of stool (65%) and blood (25.6%), and 5,461 (60.6%) were isolated from nonhuman origins, such as animals (47.2%), food (27.7%) and animal environments (18.6%). In human isolates, a total of 104 serotypes were identified and the most frequent ones were Enteritidis, Typhimurium, S . I. 4,[5],12:i:-, Dublin and Typhi. A consistent reduction of the Enteritidis proportion was observed over the years. Among the 156 serotypes identified in isolates with nonhuman origins, Enteritidis, Mbandaka, Typhimurium, Agona and Anatum were ranked as the top five Salmonella serotypes; in more recent years, S . Heidelberg has increased in frequency. Although with different proportions, the top 10 prevalent serotypes were identified in both human and nonhuman origins, underscoring the role of animals, food products and environment as reservoirs of Salmonella with potential to cause human salmonellosis.

Salmonella enterica serotypes from human and nonhuman sources in Sao Paulo State, Brazil, 2004-2020

ABSTRACT Salmonellosis ranks among the most frequently reported zoonosis worldwide and is often associated with foodborne outbreaks. Since the 1950s, the distribution of Salmonella serotypes in Sao Paulo State, Brazil, has been documented and periodically reported. In this study, we updated the data on the distribution of Salmonella serotypes received in our reference laboratory, isolated from human infections and nonhuman sources, from 2004 to 2020. In that period, a total of 9,014 Salmonella isolates were analyzed, of which 3,553 (39.4%) were recovered from human samples, mainly of stool (65%) and blood (25.6%), and 5,461 (60.6%) were isolated from nonhuman origins, such as animals (47.2%), food (27.7%) and animal environments (18.6%). In human isolates, a total of 104 serotypes were identified and the most frequent ones were Enteritidis, Typhimurium, S . I. 4,[5],12:i:-, Dublin and Typhi. A consistent reduction of the Enteritidis proportion was observed over the years. Among the 156 serotypes identified in isolates with nonhuman origins, Enteritidis, Mbandaka, Typhimurium, Agona and Anatum were ranked as the top five Salmonella serotypes; in more recent years, S . Heidelberg has increased in frequency. Although with different proportions, the top 10 prevalent serotypes were identified in both human and nonhuman origins, underscoring the role of animals, food products and environment as reservoirs of Salmonella with potential to cause human salmonellosis.

Antimicrobial susceptibility, phage types, and pulse types of Salmonella Typhimurium, in São Paulo, Brazil.

A total of 283 Salmonella Typhimurium strains isolated from cases of human infections and non human sources, were examined for antimicrobial susceptibility and the incidence of resistance was 38% and multiple resistance (to three or more antimicrobials) was 15%. All 43 multidrug-resistant strains (MDR) and 13 susceptible ones were characterized by phage typing and pulsed- field gel electrophoresis (PFGE). The strains encompassed 14 definitive phage types (DT), three were untypable (UT), and 18 atypicals or reaction does not conform (RDNC), which belonged to 21 PFGE patterns, A1-A21. The predominant phage types were DT49, DT193, and RDNC and two strains belonging to DT 104 and 104b were also identified. The most common PFGE patterns were A1 and A8. Analysis by PFGE and phage typing demonstrated that the most of the MDR were multiclonal and association among multiresistance, phage typing, and PFGE patterns was not so significant.

Antimicrobial susceptibility, phage types, and pulsetypes of Salmonella Typhimurium, in São Paulo, Brazil

A total of 283 Salmonella Typhimurium strains isolated from cases of human infections and non human sources, were examined for antimicrobial susceptibilityand the incidence of resistance was 38 percent and multiple resistance (to three or more antimicrobials) was 15 percent. All 43 multidrug-resistant strains (MDR) and 13 susceptible ones were characterized by phage typing and pulsed- field gel electrophoresis (PFGE). The strains encompassed 14 definitive phage types (DT), three were untypable (UT), and 18 atypicals or reaction does not conform (RDNC), which belonged to 21 PFGE patterns, A1-A21. The predominant phage types were DT49, DT193, and RDNC and two strains belonging to DT 104 and 104b were also identified. The most commum PFGE patterns were A1 and A8. Analysis by PFGE and phage typing demonstrated that the most of the MDR were multiclonal and association among multiresistance, phage typing, and PFGE patterns was not so significant.

Comparação fenotípica e genotípica entre cepas de Salmonella enterica subsp. entérica sorotipo 1, 4[5], 12: i: -e de Salmonella typhimurium / Phenotipic and genotipic comparison amog Salmonella enterica subsp serotipe 1, 4[5], 12: i: -e and Salmonella typhimurium strains

A salmonelose é uma zoonose mundialmente distribuída e transmitida por alimentos contaminados. O gênero Salmonella é subdividido em sorotipos (sorovares) de acordo com os antígenos somáticos (O) e flagelares (H), e a grande maioria apresenta o fenômeno da variação de fase com expressão alternada de duas fases flagelares. Salmonella Typhimurium é um dos principais sorotipos associados com infecções humanas e apresenta uma considerável multirresistência (MR) aos antimicrobianos. S. enterica subsp. enterica sorotipo 1,4,[5],12:i:- é um sorotipo monofásico antigenicamente relacionado com S. Typhimurium (1,4,[5],12:i:1,2) e que apresentou uma freqüência de isolamento significativa na década de 90, no Estado de São Paulo. O objetivo deste trabalho foi caracterizar cepas destes dois sorotipos, por métodos fenotípicos e genotípicos, e verificar sua similaridade.Das 517 cepas monofásicas, isoladas de humanos e não humanos no período de 1991 a 2000, no Estado de São Paulo, e analisadas quanto à presença de fljB por PCR, 148 (28,6%) amplificaram o fragmento correspondente ao gene fljB-H:1,2, sendo assim, classificadas como S. Typhimurium. Entre as 369 cepas fljB-negativas, submetidas aos testes de suscetibilidade aos antimicrobianos, 44 (12%) apresentaram MR para 2-13antimicrobianos. Um total de 53 cepas de S. I 1,4,[5],12:i:- (42 MR e 11 sensíveis) e 45 de S.Typhimurium (35 MR para 2-7 antimicrobianos e 10 sensíveis) foram analisadas por fagotipagem, perfil plasmideal e PFGE. As cepas monofásicas apresentaram sensibilidade variada aos fagos do esquema de fagotipagem específico para S. Typhimurium, sendo distribuídas em 14 fagotipos, quatro dos quais estavam entre os 22 detectados em S. Typhimurium. Foram identificados 14 perfis plasmideais entre as cepas monofásicas e 10 entre as de S. Typhimurium, com a prevalência do plasmídeo de 60 MDa, respectivamente, em 94% e 84% das cepas. A análise por PFGE, após digestão das cepas com a enzima XbaI, identificou 33 e 32 perfis,...

Comparação fenotípica e genotípica entre cepas de Salmonella enterica subsp. entérica sorotipo 1, 4[5], 12: i: -e de Salmonella typhimurium

A salmonelose é uma zoonose mundialmente distribuída e transmitida por alimentos contaminados. O gênero Salmonella é subdividido em sorotipos (sorovares) de acordo com os antígenos somáticos (O) e flagelares (H), e a grande maioria apresenta o fenômeno da variação de fase com expressão alternada de duas fases flagelares. Salmonella Typhimurium é um dos principais sorotipos associados com infecções humanas e apresenta uma considerável multirresistência (MR) aos antimicrobianos. S. enterica subsp. enterica sorotipo 1,4,[5],12:i:- é um sorotipo monofásico antigenicamente relacionado com S. Typhimurium (1,4,[5],12:i:1,2) e que apresentou uma freqüência de isolamento significativa na década de 90, no Estado de São Paulo. O objetivo deste trabalho foi caracterizar cepas destes dois sorotipos, por métodos fenotípicos e genotípicos, e verificar sua similaridade.Das 517 cepas monofásicas, isoladas de humanos e não humanos no período de 1991 a 2000, no Estado de São Paulo, e analisadas quanto à presença de fljB por PCR, 148 (28,6%) amplificaram o fragmento correspondente ao gene fljB-H:1,2, sendo assim, classificadas como S. Typhimurium. Entre as 369 cepas fljB-negativas, submetidas aos testes de suscetibilidade aos antimicrobianos, 44 (12%) apresentaram MR para 2-13antimicrobianos. Um total de 53 cepas de S. I 1,4,[5],12:i:- (42 MR e 11 sensíveis) e 45 de S.Typhimurium (35 MR para 2-7 antimicrobianos e 10 sensíveis) foram analisadas por fagotipagem, perfil plasmideal e PFGE. As cepas monofásicas apresentaram sensibilidade variada aos fagos do esquema de fagotipagem específico para S. Typhimurium, sendo distribuídas em 14 fagotipos, quatro dos quais estavam entre os 22 detectados em S. Typhimurium. Foram identificados 14 perfis plasmideais entre as cepas monofásicas e 10 entre as de S. Typhimurium, com a prevalência do plasmídeo de 60 MDa, respectivamente, em 94% e 84% das cepas. A análise por PFGE, após digestão das cepas com a enzima XbaI, ...

Detection of cytotoxic necrotizing factor types 1 and 2 among fecal Escherichia coli isolates from Brazilian children with and without diarrhea.

The enteropathogenic role of cytotoxic necrotizing factor (CNF)-producing Escherichia coli was investigated by searching cnf genes among 2074 isolates from 200 children with and 200 without acute diarrhea in Brazil. Fourteen (7%) cases versus 10 (5%) control children carried at least one cnf positive isolate (P = 0.50) and most isolates expressed CNF type 1. DNA sequences of virulence factors of extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) were detected in 78.6% of CNF1-producing isolates. Besides not being associated with human acute diarrhea, the CNF1-producing isolates here identified may represent potential ExPEC transitorily composing the normal intestinal flora.

Detection of cytotoxic necrotizing factor types 1 and 2 among fecal Escherichia coli isolates from brazilian children with and without diarrhea

The enteropathogenic role of cytotoxic necrotizing factor (CNF)-producing Escherichia coli was investigated by searching cnf genes among 2074 isolates from 200 children with and 200 without acute diarrhea in Brazil. Fourteen (7 percent) cases versus 10 (5 percent) control children carried at least one cnf positive isolate (P = 0.50) and most isolates expressed CNF type 1. DNA sequences of virulence factors of extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) were detected in 78.6 percent of CNF1-producing isolates. Besides not being associated with human acute diarrhea, the CNF1-producing isolates here identified may represent potential ExPEC transitorily composing the normal intestinal flora.

Antimicrobial resistance of Salmonella serotypes isolated from slaughter-age pigs and environmental samples.

The aim of this study was to determine the antimicrobial resistance patterns of Salmonella strains isolated from slaughter-age pigs and environmental samples collected at modern swine raising facilities in Brazil. Seventeen isolates of six serotypes of Salmonella enterica subsp. enterica were isolated out of 1,026 collected samples: Salmonella Typhimurium (1), Salmonella Agona (5), Salmonella Sandiego (5), Salmonella Rissen (1), Salmonella Senftenberg (4), and Salmonella Javiana (1). Resistance patterns were determined to extended-spectrum penicillin (ampicillin), broad-spectrum cephalosporins (cefotaxime and ceftriaxone), aminoglycosides (streptomycin, neomycin, gentamicin, amikacin, and tobramycin), narrow-spectrum quinolone (nalidixic acid), broad-spectrum quinolone (ciprofloxacin and norfloxacin), tetracycline, trimethoprim, and chloramphenicol. Antimicrobial resistance patterns varied among serotypes, but isolates from a single serotype consistently showed the same resistance profile. All isolates were resistant to tetracycline, streptomycin, and nalidixic acid. One isolate, Salmonella Rissen, was also resistant to cefotaxime and tobramycin. All serotypes were susceptible to ceftriaxone, norfloxacin, ciprofloxacin, ampicillin, gentamicin, and chloramphenicol. The high resistance to tetracycline and streptomycin may be linked to their common use as therapeutic drugs on the tested farms. No relation was seen between nalidixic acid and fluoroquinolone resistance.

Salmonella em carcaças de frango congeladas / Salmonella in broiler frozen carcasses

Um total de 150 carcaças de frango congeladas, de quatro marcas comerciais, foram analisadas para pesquisa de Salmonella. Foram examinadas 43 carcaças de cada uma das marcas A, B, D e 21 da marca C. Observou-se um percentual de 32,0 de contaminaçäo. Foram identificados 11 sorotipos: S. Agona, S. Anatum, S. Enteritidis, S. Hadar, S. Havana, S. Mbandaka, S. Montevideo, S. Ouakam, S. Poona, S. Schwarzengrund e S. I 4, 5, 12: -. O antibiograma das cepas mostrou 100 de resistência à ampicilina, 75,0 à cefalotina, 52,1 à cefoxitina, 22,9 à tobramicina, 6,2 à polimixina B e à tetraciclina, 4,2 à gentamicina e 2,1 à netilmicina, ao aztreonam e à amicacina. Todas as cepas apresentaram sensibilidade total ao cloranfenicol e ao sulfazotrim.

Salmonella: determinaçäo de sorotipos e resistência a agentes antimicrobianos de cepas isoladas de carcaças de frango comercializadas na regiäo de Säo José do Rio Preto - SP / Salmonella: serotyping and antimicrobial susceptibility patterns of strains isolated from chickem carcasse samples commercializede in the Säo José do Rio Preto area - SP

De abril de 1995 a dezembro de 1996, foram estudadas 160 amostras de carcaças de frango, comercializadas na Regiäo de Säo José do Rio Preto - SP. Foram determinados os sorotipos e perfis de sensibilidade aos agentes antimicrobianos de todas as cepas de Samonella isoladas. Das carcaças analisadas, 54,38(por cento) estavam contaminadas por Samonella. Foram identificados 18 diferentes sorotipos, dentre os quais Samonella Enteritidis correspondeu a 59,77(por cento). Verificou-se que 13,79 (por cento) das cepas de Samonella apresentaram resistência aos agentes antimicrobianos testados. Os resultados obtidos demonstraram o alto índice de contaminaçäo por Samonella em carne de frango. Considerando o consumo de alimentos de origem animal, principalmente de aves, por um grande número de pessoas, este fato possivelmente tem propiciado a ocorrência de numerosos surtos por S. Entidades na nossa regiäo, nos últimos anos

Observaçöes laboratoriais sobre surtos alimentares de Salmonella sp, ocorridos na Grande Säo Paulo, no periódo de 1994 a 1997 / Laboratorial observation about foodborne salmonellosis outbreaks in Great Säo Paulo city, from 1994 to 1997

As enfermidades transmitidas por alimentos (ETAs) causadas por salmonela säo consideradas um dos mais importantes problemas de Saúde Pública, tanto nos países em desenvolvimento como em países desenvolvidos. Significativos aumento no número de surtos por S. Enterititidis tem sido observado na Grande Säo Paulo desde 1994. Foram relatados no período de outubro de 1994 a junho de 1997, 18 surtos de ETAs causadas por Samonella envolvendo 23 alimentos, sendo que em 13 (72,2 por cento) surtos foram identificados Salmonella Enteritidis. Os alimentos envolvidos foram predominantemente de origem animal, em especial ovos e seus derivados. O método analítico empregado foi uma modificaçäo do descrito no "Compendium of Methods for the Microbiological Examination of Foods", APHA. A relevância e a gravidade deste microrganismo como agente de ETA é discutido neste trabalho

Salmonella: sorotipos identificados das cepas isoladas de pacientes hospitalizados e näo hospitalizados, na Regiäo de Presidente Prudente, SP, no periódo de 1978-1997 / Sorotypes idnetified of strains isolated from hospitalized non-hospitalized patients, in Presidente Prudente area, SP, during the period of 1978-1997

No período de 1978-1997, foram identificadas 413 cepas de Salmonella, isoladas de coproculturas de origem ambulatorial e hospitalar, no Setor de Microbiologia do Laboratório I Regional de Presidente Prudente. Determinou-se a sensibilidade aos agentes antimicrobianos de 394 cepas de Samonella. Entre as cepas isoladas de coproculturas de origem ambulatorial observou-se grande diversidade de sorotipos (27 sorotipos) com predominância de S. Enteritidis 24,4(por cento), S. Infantis 19,3(por cento) e S. Agona 10,1(por cento). Em relaçäo às cepas isoladas de pacientes hospitalizados, foram identificados 8 diferentes sorotipos, sendo que a S. Typhimurium representou o sorotipo prevalente 95,6(por cento), seguido de S. Typhi 1(por cento) e S. I4,12:i:-1(por cento). Com relaçäo à sensibilidade aos agentes antimicrobianos, as cepas de origem hospitalar apresentam multirresistência, enquanto que aquelas de origem ambulatorial foram sensíveis à maioria dos antimicrobianos utilizados

Marcadores epidemiológicos de Salmonella typhimurium e Salmonella agona / Epidemiologic markers of Salmonella typhimurium and Salmonella agona

Among S. typhimurium and S. agona strains isolated during the period from 1971 to 1987, the biotypes, colicine types and resistance patterns were determined for 734 S. typhimurium and 631 S. agona strains. Among 734 S. typhimurium strains 65 biotypes were disclosed with prevalence of biotypes 1a (28.34), 1b (29.84) and 9 bi (18.28). Concerning S. agona, the biotype 1a represented by 87.16, was the commonest clone among our strains. Although colicine typing added little information to characterize these serotypes, it should be usefull when applied in epidemiological study of outbreaks. It was observed multiply antimicrobial resistance mainly among human strains, particularly from nosocomial origins.

Farinha de carne como fonte de Salmonella em granja avícola / Meat meal as source fo Salmonella on a poultry farm

Foi investigada a presença de Salmonella em uma granja comercial de frangos de corte. Foram encontrados 22 sorotipos de Salmonella, em amostras de farinha de carne, raçäo, fezes de rato e cama de aves. O quadro observado sugere que a farinha de carne foi o principal introdutor das Salmonella na granja, disseminando-as entre as aves. O antibiograma das salmonelas isoladas mostrou os seguintes percentuais de resistências: carbecilina (94,23%), tetraciclina (92,23%), ácido nalidíxico (73,08%), nitrofurantoína (65,38%), cefalotina (59,61%), linco-spectin (44,23%), canamicina (36,54%), amicacina (25,0%), neomicina (23,09%), cloranfenicol (19,23%), ampicilina (11,38%), cefoxitina (11,54%), cotrimazina (11,54%) e gentamicina (1,92%)